python+opencv图像分割实现分割不规则ROI区域方法汇总
在图像分割领域,一个重要任务便是分割出感兴趣(ROI)区域。如果是简易的矩形ROI区域其实是非常容易分割的,opencv的官方python教程里也有教到最简易的矩形ROI分割(剪裁),其本质是多维数组(矩阵)的切片。但是现实情况中,ROI是不规则的多边形,也可能是曲线边界,那么该如何分割出来呢?下面总结几种思路。
可能只提供核心部分的代码示例,具体应用要结合你自己的项目来修正。
一、已知边界坐标,直接画出多边形
例:最基础的画个四边形
# 定义四个顶点坐标 pts = np.array([[10, 5], [50, 10], [70, 20], [20, 30]], np.int32) # 顶点个数:4,矩阵变成4*1*2维 # OpenCV中需要将多边形的顶点坐标变成顶点数×1×2维的矩阵 # 这里 reshape 的第一个参数为-1, 表示“任意”,意思是这一维的值是根据后面的维度的计算出来的 pts = pts.reshape((-1, 1, 2)) cv2.polylines(img, [pts], True, (0, 255, 255))
上例中,img是你的画布原图。pts你可以随便改,改成自己的边界点。注意cv2.polylines中参数pts要加[ ]。
二、通过形态学操作产生Mask
腐蚀、膨胀之后,产生二值化(非黑即白)的mask,然后和图像做与运算。
腐蚀膨胀的操作方法简单复习一下:
kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_ELLIPSE, (10, 10)) # 矩形结构:MORPH_RECT kernel1 = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (15, 15)) # 椭圆结构:MORPH_ELLIPSE img = cv2.erode(img, kernel) # 腐蚀 img = cv2.dilate(img, kernel) # 膨胀
我们都知道,腐蚀膨胀完后会得到一个二值化的掩模(mask)。
mask = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2BGR) #img是腐蚀膨胀完的图片 ROI = cv2.bitwise_and(mask, oriimg) #oriimg是原始图片 cv2.imshow('ROI',ROI) if cv2.waitKey(500) and 0xff == ord('q'): cv2.destroyAllWindows()
讲原始图片和mask做一个掩模就可以得到最终图像了(例子此处就不举了因为一些图片涉及科研内容,paper还未发表,请自行试一下吧)。
三、人机交互式
用鼠标点击,产生多边形。
这样是比较精确的,比较是人工操作,但是比较麻烦,如果有上万张图片,你不可能每张都自己鼠标去分割出来一下。但是这个方法可以用于获取ROI的ground-truth,然后用来和机器分割的结果做对比,计算准确率、召回率等评价指标!所以学一下还是有用的。
#!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Wed May 29 19:18:28 2019 @author: youxinlin """ import cv2 import numpy as np # -----------------------鼠标操作相关------------------------------------------ lsPointsChoose = [] tpPointsChoose = [] pointsCount = 0 count = 0 pointsMax = 6 def on_mouse(event, x, y, flags, param): global img, point1, point2, count, pointsMax global lsPointsChoose, tpPointsChoose # 存入选择的点 global pointsCount # 对鼠标按下的点计数 global img2, ROI_bymouse_flag img2 = img.copy() # 此行代码保证每次都重新再原图画 避免画多了 # ----------------------------------------------------------- # count=count+1 # print("callback_count",count) # -------------------------------------------------------------- if event == cv2.EVENT_LBUTTONDOWN: # 左键点击 pointsCount = pointsCount + 1 # 感觉这里没有用?2018年8月25日20:06:42 # 为了保存绘制的区域,画的点稍晚清零 # if (pointsCount == pointsMax + 1): # pointsCount = 0 # tpPointsChoose = [] print('pointsCount:', pointsCount) point1 = (x, y) print (x, y) # 画出点击的点 cv2.circle(img2, point1, 10, (0, 255, 0), 2) # 将选取的点保存到list列表里 lsPointsChoose.append([x, y]) # 用于转化为darry 提取多边形ROI tpPointsChoose.append((x, y)) # 用于画点 # ---------------------------------------------------------------------- # 将鼠标选的点用直线连起来 print(len(tpPointsChoose)) for i in range(len(tpPointsChoose) - 1): print('i', i) cv2.line(img2, tpPointsChoose[i], tpPointsChoose[i + 1], (0, 0, 255), 2) # ---------------------------------------------------------------------- # ----------点击到pointMax时可以提取去绘图---------------- cv2.imshow('src', img2) # -------------------------右键按下清除轨迹----------------------------- if event == cv2.EVENT_RBUTTONDOWN: # 右键点击 print("right-mouse") pointsCount = 0 tpPointsChoose = [] lsPointsChoose = [] print(len(tpPointsChoose)) for i in range(len(tpPointsChoose) - 1): print('i', i) cv2.line(img2, tpPointsChoose[i], tpPointsChoose[i + 1], (0, 0, 255), 2) cv2.imshow('src', img2) # -------------------------双击 结束选取----------------------------- if event == cv2.EVENT_LBUTTONDBLCLK: # -----------绘制感兴趣区域----------- ROI_byMouse() ROI_bymouse_flag = 1 lsPointsChoose = [] def ROI_byMouse(): global src, ROI, ROI_flag, mask2 mask = np.zeros(img.shape, np.uint8) pts = np.array([lsPointsChoose], np.int32) # pts是多边形的顶点列表(顶点集) pts = pts.reshape((-1, 1, 2)) # 这里 reshape 的第一个参数为-1, 表明这一维的长度是根据后面的维度的计算出来的。 # OpenCV中需要先将多边形的顶点坐标变成顶点数×1×2维的矩阵,再来绘制 # --------------画多边形--------------------- mask = cv2.polylines(mask, [pts], True, (255, 255, 255)) ##-------------填充多边形--------------------- mask2 = cv2.fillPoly(mask, [pts], (255, 255, 255)) cv2.imshow('mask', mask2) cv2.imwrite('mask.jpg', mask2) image,contours, hierarchy = cv2.findContours(cv2.cvtColor(mask2, cv2.COLOR_BGR2GRAY), cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_NONE) ROIarea = cv2.contourArea(contours[0]) print("ROIarea:",ROIarea) ROI = cv2.bitwise_and(mask2, img) cv2.imwrite('ROI.jpg', ROI) cv2.imshow('ROI', ROI) img = cv2.imread('3.png') # --------------------------------------------------------- # --图像预处理,设置其大小 # height, width = img.shape[:2] # size = (int(width * 0.3), int(height * 0.3)) # img = cv2.resize(img, size, interpolation=cv2.INTER_AREA) # ------------------------------------------------------------ ROI = img.copy() cv2.namedWindow('src') cv2.setMouseCallback('src', on_mouse) cv2.imshow('src', img) cv2.waitKey(0) cv2.destroyAllWindows()
你可以增加更多的功能。。。附:鼠标点击事件 :
''' EVENT_FLAG_ALTKEY = 32 摁住Alt EVENT_FLAG_CTRLKEY = 8 摁住Ctrl EVENT_FLAG_LBUTTON = 1 摁住左键 EVENT_FLAG_MBUTTON = 4 摁住中键 EVENT_FLAG_RBUTTON = 2 摁住右键 EVENT_FLAG_SHIFTKEY = 16 摁住Shift EVENT_LBUTTONDBLCLK = 7 左键双击 EVENT_LBUTTONDOWN = 1 左键击下 EVENT_LBUTTONUP = 4 左键弹起 EVENT_MBUTTONDBLCLK = 9 中键双击 EVENT_MBUTTONDOWN = 3 中键击下 EVENT_MBUTTONUP = 6 中键弹起 EVENT_MOUSEHWHEEL = 11 滚动条向左,flags>0。向右,flags<0 EVENT_MOUSEMOVE = 0 鼠标移动 EVENT_MOUSEWHEEL = 10 滚动条向上,flags>0。向下,flags<0 EVENT_RBUTTONDBLCLK = 8 中键双击 EVENT_RBUTTONDOWN = 2 中键击下 EVENT_RBUTTONUP = 5 中键弹起 '''
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