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使用SimpleITK读取和保存NIfTI/DICOM文件实例_python_脚本之家
itk_img = sitk.ReadImage('./nifti.nii.gz') img = sitk.GetArrayFromImage(itk_img) print("img shape:",img.shape) ## save out = sitk.GetImageFromArray(img) # # out.SetSpacing(itk_img.GetSpacing()) # # ou...
www.jb51.net/article/1898...htm 2024-5-10
python使用nibabel和sitk读取保存nii.gz文件实例_python_脚本之家
nib.Nifti1Image(img,img_affine).to_filename('xxxxx.nii.gz') 使用sitk 使用sitk读取nii时,读取出来的还是图片格式,可以使用他自带的函数进行处理,不过速度比较慢,建议使用GetArrayFromImage转换成numpy格式再处理,3维图像格式为(x,...
www.jb51.net/article/1898...htm 2024-5-9
python sitk.show()与imageJ结合使用常见的问题_python_脚本之家
Go to https://imagej.nih.gov/ij/plugins/nifti.html Download nifti_io.jar Go to C:\blah\blah\ImageJ\plugins\Input-Output Delete the existing nifti_io.jar file from the folder Copy the downloaded nifti_io.jar file...
www.jb51.net/article/1850...htm 2024-5-1
使用Python解决常见格式图像读取nii,dicom,mhd_python_脚本之家
读取nii后缀的NIFTI格式图像需要安装nibabel库 1 pip install nibabel 使用nib.load() 函数即可读取图像数据data, 其中dataobj就是图像矩阵 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 import os import numpy as np import nibabel as nib ...
www.jb51.net/article/2449...htm 2024-5-10