Python如何用字典完成匹配任务
更新时间：2024年09月13日 09:34:18 作者：小猪崽子～
在生物信息学领域,经常需要根据基因名称匹配其对应的编号,本文介绍了一种通过字典进行基因名称与编号匹配的方法,首先定义一个空列表存储对应编号,对于字典中不存在的基因名称,其编号默认为0
1. 问题描述
如下左图为编号与gene名称的对应关系（此处仅显示前10条），已存为字典（map_gene）
右图为我们需要去匹配的gene名称，如何根据基因名称给出对应的编号？
2. 解决方案
2.1 定义变量
首先，我们定义一个空的list来存储gene对应的编号，且因部分gene在字典map_gene中不存在，故需记录可匹配到的个数。
# 定义变量 m = [] # 存储对应编号的list t = 0 # 记录map_gene中可以匹配到的gene个数 n = 0 # 记录map_gene中不存在的gene个数
2.2 匹配gene对应的编号
# 遍历gene列表，若在map_gene中可匹配到，则保存对应编号；否则返回0.
for i in range(len(gene)):
if gene[i] in map_gene.keys():
m.append(map_gene[gene[i]])
t = t+1
else:
m.append(0)
n = n+12.3 将匹配好的结果导出存为csv格式
# 导出到csv
data = np.vstack(gene,m)
df = pd.DataFrame(data)
df.to_csv('gene_match.csv')csv文档截图如下，仅选取0-20gene展示结果，其中第18个gene rutr在gene_map中无匹配，故编号为0.
总结
匹配成功，撒花完结。
以上为个人经验，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持脚本之家。
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