R语言入门使用RStudio制作包含Rcpp代码的R包

前面博客中有提及，当我们进行模拟想要再次进行提速时，通常都会使用Rcpp将我们的R代码改成C++代码。具体Rcpp的使用可参考博客：Rcpp入门R代码提速方法过程，R语言学习RcppEigen进行矩阵运算。

平时在我们使用的时候，直接使用Rcpp::sourceCpp()就可以直接将我们的C++代码中的函数进行导入，这不会遇到什么问题，但如果我们想要使用snowfall进行并行时就不能再这样做了。遇到的问题在博客中有进行说明：R中两种常用并行方法——2. snowfall。

而解决这个问题的有效途径，就是将我们的Rcpp代码进行打包，然后再对包进行调用。下面我们就来介绍：如何使用RStudio制作包含Rcpp代码的R包。

1. 创建项目

首先我们进入RStudio，然后选择左上角的File—New Project。

新建Project后会得到如下图所示的界面，我们接着选New Directory，

再选择R Package，

最后在得到如下所示的界面后，我们在Package Name中输入我们包的名称，然后再在下面选择Add，将我们的.cpp格式的C++文件选择进去（里面是我们的函数）。最后点击Create package，即可创建一个R包的project了。

创建完之后，RStudio会弹出一个新的界面，如下图所示。

然后我们需要对下述界面里面的一些配置文件进行一定的修改，然后才能完善我们的R包。

2. 修改一些文件

从上面界面的右下角的Files框框中，可以发现已经多出了很多文件，包括DISCRIPTION等文件以及man、R、src三个文件夹。

在R文件夹中存的是R代码，src文件夹中是C++代码（包括我们之前添加的C++代码）。

可能你的C++代码中只有添加进去.cpp文件，由于我的代码中不止使用了#include <Rcpp.h>，还有使用#include <RcppEigen.h>，这里注意，一定需要在DISCRIPTION文件的最后添加下面两行（尤其是LinkingTo，不然会编译失败）：

Imports: Rcpp
LinkingTo: Rcpp, RcppEigen

此外还可以在DISCRIPTION文件，添加一些作者姓名等一些重要信息。

直接点开DISCRIPTION文件，会如上图所示，我们直接进行修改即可。这里需要注意一下，Imports里面涉及到软件的版本，是根据你R中现有包的版本来，如果想让更多的电脑使用，在不影响程序使用的前提下，可以适当降低依赖包的版本。

3. 打包

最后一步就是打包，这里介绍两种打包方式：

选择上方的Build——Build Source Package

点击右上角的Build中的Build & Reload

第一种方法打包成功后，当下面出现DONE字样时，说明包会在默认路径下安详地躺着了。
第二种方法打包成功后会自动library载入。

4. 使用Eigen或其它依赖库会出现的问题

如果我们再.cpp文件中使用的不止有Rcpp库，还有别的库，比如说Eigen。这时需要注意，用上面的方法打包是失败的，会显示没有Eigen这个库。

这个解决的方法也很简单，直接在DISCRIPTION文件的LinkTo后面加上RcppEigen即可，如下图所示：

可能遇到的其他问题 制作R包后载入包内函数时，出现 “…” not available for .Call() for package “…” 错误

问题解决传送门

R包制作后出现not available for错误问题解决

最后，就可以开心地享用新鲜出炉的包来做snowfall并行或者发给别人使用啦！

以上就是R语言入门使用RStudio制作包含Rcpp代码的R包的详细内容，更多关于RStudio制作Rcpp代码R包的资料请关注脚本之家其它相关文章！

最新评论