R语言数据可视化绘图Slope chart坡度图画法

 更新时间:2022年02月17日 09:12:47   作者:黄小仙  
这篇文章主要为大家介绍了R语言数据可视化绘图Slope chart坡度图的画法示例详解,有需要的朋友可以借鉴参考下,希望能够有所帮助,祝大家多多进步,早日升职加薪

今天小仙给大家分享一下Slope chart(坡度图)的画法,我在paper中看到的图是这样的

Figure from the paper.png

这个图的意思大概是Nasal Tissue比Brochial Tissue的ACE2表达量高(ACE2就是新冠病毒的受体啦) 。为了复刻这张图,小仙捏造了一组差不多的数据,竟然感觉比原图好看!

废话不多说,进入正题。

Step1. 绘图数据的准备

首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,建议大家在excel中保存成csv格式。
作图数据格式如下:

绘图数据格式

Step2. 绘图数据的读取

data<-read.csv(“your file path”, header = T, check.names=F)
#注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没有列名就用header=F
#注释:R读取数据的时候,默认会把列名里的空格变成 ".",check.names=F就不会变了

Step3. 绘图所需package的安装、调用

library(ggplot2) 
library(reshape2)              
# 注释:package使用之前需要调用

Step4. 绘图

data_melt<-melt(data,id.vars = "Sample")
# 注释:将原始的宽数据变成长数据,方便画图
p<-ggplot(data_melt,aes(x=variable,y=value,group=Sample))+
   geom_line(color="gray", size=1)+
   geom_point(aes(fill=Sample),shape=21, size=3)+
   theme_bw()+labs(x="",y="Relative expression")
p

point的shape类型

直接画出来的图就是下面这样子的,线段和圆圈都是锯齿状的,对图片质量要求比较高、想让直线变平滑的朋友,可以参考我之前的分享《R语言作图技巧——导出高清图》。

如果把geom_point()语句跟geom_point()语句颠倒一下会发生什么呢?

p<-ggplot(data_melt,aes(x=variable,y=value,group=Sample))+ 
   geom_point(aes(fill=Sample),shape=21, size=3)+
   geom_line(color="gray", size=1)+
   theme_bw()+labs(x="",y="Relative expression")
p

语句颠倒,连线就会覆盖点的一部分,如果你想让哪个形状放在最上层,就把相应的画图语句放在后面就可以啦。

以上就是R语言数据可视化绘图Slope chart坡度图画法的详细内容,更多关于R语言数据可视化绘图坡度图的资料请关注脚本之家其它相关文章!

相关文章

  • R语言 实现data.frame 分组计数、求和等

    R语言 实现data.frame 分组计数、求和等

    这篇文章主要介绍了R语言 实现data.frame 分组计数、求和等操作,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
    2021-03-03
  • R语言 实现将1对多数据与1对1数据互换

    R语言 实现将1对多数据与1对1数据互换

    这篇文章主要介绍了R语言 实现将1对多数据与1对1数据互换的操作,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
    2021-03-03
  • R语言 中文乱码的解决方案

    R语言 中文乱码的解决方案

    这篇文章主要介绍了R语言 中文乱码的解决方案,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
    2021-04-04
  • R语言实现漂亮的ROC图效果

    R语言实现漂亮的ROC图效果

    pROC是一个专门用来计算和绘制ROC曲线的R包,目前已被CRAN收录,因此安装也非常简单,同时该包也兼容ggplot2函数绘图,本次就教大家怎么用pROC来快速画出ROC图,感兴趣的朋友一起看看吧
    2022-06-06
  • R语言学习Rcpp基础知识全面整理

    R语言学习Rcpp基础知识全面整理

    这篇文章主要介绍了R语言学习Rcpp知识的全面整理,包括相关配置说明,常用数据类型及建立等基础知识的全面详解,有需要的朋友可以借鉴参考下,希望能够有所帮助
    2021-11-11
  • R语言条形图创建方法

    R语言条形图创建方法

    在本篇文章里小编给大家整理的是一篇关于R语言条形图创建方法,有需要的朋友们可以跟着学习参考下。
    2021-04-04
  • R语言的数据输入深入讲解

    R语言的数据输入深入讲解

    这篇文章主要介绍了R语言的数据输入深入讲解,代码实例讲解的很清晰,有需要的同学可以学习下
    2021-03-03
  • 如何使用R语言做逻辑回归详解

    如何使用R语言做逻辑回归详解

    逻辑回归属于概率统计的分类算法模型的算法,是根据一个或者多个特征进行类别标号预测,下面这篇文章主要给大家介绍了关于如何使用R语言做逻辑回归的相关资料,需要的朋友可以参考下
    2022-07-07
  • R语言 解决安装ggplot2报错的问题

    R语言 解决安装ggplot2报错的问题

    这篇文章主要介绍了R语言 解决安装ggplot2报错的问题,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
    2021-04-04
  • R语言实现PCA主成分分析图的示例代码

    R语言实现PCA主成分分析图的示例代码

    主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种无监督的数据降维方法,通过主成分分析可以尽可能保留下具备区分性的低维数据特征。本文将用R语言实现PCA主成分分析图,需要的可以参考一下
    2022-04-04

最新评论