记一次MongoDB性能问题(从MySQL迁移到MongoDB)

 更新时间:2017年03月22日 15:53:30   投稿:mdxy-dxy  
最近忙着把一个项目从MySQL迁移到MongoDB,在导入旧数据的过程中,遇到了些许波折,犯了不少错误,但同时也学到了不少知识,遂记录下来,需要的朋友可以参考下

公司为这个项目专门配备了几台高性能务器,清一色的双路四核超线程CPU,外加32G内存,运维人员安装好MongoDB后,就交我手里了,我习惯于在使用新服务器前先看看相关日志,了解一下基本情况,当我浏览MongoDB日志时,发现一些警告信息:

WARNING: You are running on a NUMA machine. We suggest launching mongod like this to avoid performance problems: numactl –interleave=all mongod [other options]

当时我并不太清楚NUMA是什么东西,所以没有处理,只是把问题反馈给了运维人员,后来知道运维人员也没有理会这茬儿,所以问题的序幕就这样拉开了。

迁移工作需要导入旧数据。MongoDB本身有一个mongoimport工具可供使用,不过它只接受json、csv等格式的源文件,不适合我的需求,所以我没用,而是用PHP写了一个脚本,平稳运行了一段时间后,我发现数据导入的速度下降了,同时PHP抛出异常:

cursor timed out (timeout: 30000, time left: 0:0, status: 0)

我一时判断不出问题所在,想想先在PHP脚本里加大Timeout的值应付一下:

<?php
MongoCursor::$timeout = -1;
?>

可惜这样并没有解决问题,错误反倒变着花样的出现了:

max number of retries exhausted, couldn't send query, couldn't send query: Broken pipe

接着使用strace跟踪了一下PHP脚本,发现进程卡在了recvfrom操作上:

shell> strace -f -r -p <PID>
recvfrom(<FD>,

通过如下命令查询recvfrom操作的含义:

shell> apropos recvfrom
receive a message from a socket

或者按照下面的方式确认一下:

shell> lsof -p <PID>
shell> ls -l /proc/<PID>/fd/<FD>

此时如果查询MongoDB的当前操作,会发现几乎每个操作会消耗大量的时间:

mongo> db.currentOp()

与此同时,运行mongostat的话,结果会显示很高的locked值。

我在网络上找到一篇:MongoDB Pre-Splitting for Faster Data Loading and Importing,看上去和我的问题很类似,不过他的问题实质是由于自动分片导致数据迁移所致,解决方法是使用手动分片,而我并没有使用自动分片,自然不是这个原因。

询问了几个朋友,有人反映曾遇到过类似的问题,在他的场景里,问题的主要原因是系统IO操作繁忙时,数据文件预分配堵塞了其它操作,从而导致雪崩效应。

为了验证这种可能,我搜索了一下MongoDB日志:

shell> grep FileAllocator /path/to/log
[FileAllocator] allocating new datafile ... filling with zeroes...
[FileAllocator] done allocating datafile ... took ... secs

我使用的文件系统是ext4(xfs也不错 ),创建数据文件非常快,所以不是这个原因,但如果有人使用ext3,可能会遇到这类问题,所以还是大概介绍一下如何解决:

MongoDB按需自动生成数据文件:先是<DB>.0,大小是64M,然后是<DB>.1,大小翻番到128M,到了<DB>.5,大小翻番到2G,其后的数据文件就保持在2G大小。为了避免可能出现的问题,可以采用事先手动创建数据文件的策略:

#!/bin/sh

DB_NAME=$1

cd /path/to/$DB_NAME

for INDEX_NUMBER in {5..50}; do
  FILE_NAME=$DB_NAME.$INDEX_NUMBER

  if [ ! -e $FILE_NAME ]; then
    head -c 2146435072 /dev/zero > $FILE_NAME
  fi
done

注:数值2146435072并不是标准的2G,这是INT整数范围决定的。

最后一个求助方式就是官方论坛了,那里的国际友人建议我检查一下是不是索引不佳所致,死马当活马医,我激活了Profiler记录慢操作:

mongo> use <DB>
mongo> db.setProfilingLevel(1);

不过结果显示基本都是insert操作(因为我是导入数据为主),本身就不需要索引:

mongo> use <DB>
mongo> db.system.profile.find().sort({$natural:-1})

问题始终没有得到解决,求人不如求己,我又重复了几次迁移旧数据的过程,结果自然还是老样子,但我发现每当出问题的时候,总有一个名叫irqbalance的进程CPU占用率居高不下,搜索了一下,发现很多介绍irqbalance的文章中都提及了NUMA,让我一下子想起之前在日志中看到的警告信息,我勒个去,竟然绕了这么大一个圈圈!安下心来仔细翻阅文档,发现官方其实已经有了相关介绍,按如下设置搞定:

shell> echo 0 > /proc/sys/vm/zone_reclaim_mode
shell> numactl --interleave=all mongod [options]

关于zone_reclaim_mode内核参数的说明,可以参考官方文档

注:从MongoDB1.9.2开始:MongoDB会在启动时自动设置zone_reclaim_mode。

至于NUMA的含义,简单点说,在有多个物理CPU的架构下,NUMA把内存分为本地和远程,每个物理CPU都有属于自己的本地内存,访问本地内存速度快于访问远程内存,缺省情况下,每个物理CPU只能访问属于自己的本地内存。对于MongoDB这种需要大内存的服务来说就可能造成内存不足,NUMA的详细介绍,可以参考老外的文章

理论上,MySQL、Redis、Memcached等等都可能会受到NUMA的影响,需要留意。

您可能感兴趣的文章:

相关文章

  • 在Linux服务器中配置mongodb环境的步骤

    在Linux服务器中配置mongodb环境的步骤

    这篇文章主要介绍了在Linux服务器中配置mongodb环境的步骤,具有一定的参考价值,感兴趣的小伙伴们可以参考一下
    2017-07-07
  • 使用Node操作MongoDB数据库的方法

    使用Node操作MongoDB数据库的方法

    这篇文章主要介绍了使用Node操作MongoDB数据库的方法,非常不错,具有参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下
    2018-01-01
  • Mongodb 删除添加分片与非分片表维护

    Mongodb 删除添加分片与非分片表维护

    MongoDB 是一个介于关系数据库和非关系数据库之间的产品,是非关系数据库当中功能最丰富,最像关系数据库的。通过本文给大家介绍Mongodb 删除添加分片与非分片表维护的相关知识,对此文感兴趣的朋友一起学习吧
    2016-01-01
  • MongoDB实现基于关键词的文章检索功能(C#版)

    MongoDB实现基于关键词的文章检索功能(C#版)

    这篇文章主要介绍了MongoDB实现基于关键词的文章检索功能(C#版)的相关资料,需要的朋友可以参考下
    2016-04-04
  • SpringBoot+MongoDB实现物流订单系统的代码

    SpringBoot+MongoDB实现物流订单系统的代码

    这篇文章主要介绍了SpringBoot+MongoDB实现物流订单系统的代码,本文通过图文实例相结合给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下
    2020-09-09
  • mongodb数据库基础知识之连表查询

    mongodb数据库基础知识之连表查询

    这篇文章主要给大家介绍了关于mongodb数据库基础知识之连表查询的相关资料,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家学习或者使用mongodb具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面来一起学习学习吧
    2019-06-06
  • MongoDB学习笔记之分组(group)使用示例

    MongoDB学习笔记之分组(group)使用示例

    这篇文章主要介绍了MongoDB学习笔记之分组(group)使用示例,本文直接给出一组测试数据,然后练习分组的基本使用,需要的朋友可以参考下
    2015-07-07
  • mongodb索引知识_动力节点Java学院整理

    mongodb索引知识_动力节点Java学院整理

    这篇文章给大家介绍了mongodb索引的建立,删除索引的方法以及唯一索引和组合索引的知识,感兴趣的朋友一起看看吧
    2017-08-08
  • PHP中安装使用mongodb数据库

    PHP中安装使用mongodb数据库

    最近有个项目,需要用php操作mongoDb数据,所以了解下mongoDb为此整理了下,有需要的小伙伴可以参考下
    2015-12-12
  • PHP中的mongodb group操作实例

    PHP中的mongodb group操作实例

    这篇文章主要介绍了PHP中的mongodb group操作实例,本文给出了3个group命令的用法,需要的朋友可以参考下
    2014-09-09

最新评论