Arlequin(人类遗传学数据分析软件) v3.5.2.2 英文绿色免费版

遗传学分析软件下载

  • 软件大小:21.6MB
  • 软件语言:英文软件
  • 软件类型:国外软件
  • 软件授权:免费软件
  • 更新时间:2019-06-24
  • 软件类别:健康医药
  • 软件官网:
  • 网友评分:软件评分
  • 应用平台:Windows平台
21.6MB
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Arlequin是款专业的人类遗传学数据分析软件。有遗传学有兴趣的用户可以通过软件对统计数据中信息的挖掘,可进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等。Arlequin集成了单倍型频率估计、Tajima中性检验、Fu中性检验以及遗传距离的估计等功能。这样就能够准确有效的对人类遗传学数据进行挖掘。感兴趣的朋友快来下载使用吧。

软件特色

  1.Molecular diversity(分子多态性);

  2.Mismatch distribution(错配分布);

  3.Haplotype frequency estimation(单倍型频率估计);

  4.Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关联);

  5.Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格平衡);

  6.Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验);

  7.Fu`s neutrality test(Fu中性检验);

  8.Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验);

  9.Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合检验,检测人群的均一性或同质性和中性选择等);

  10.Minimu Spanning Network(最小扩张树或称之为最小支撑树,,基于分子差异);

  11.AMOVA 分子差异度分析,用以评测人群的遗传结构;

  12.Pairwise genetic distances (遗传距离的估计);

  13.Exact test of population differentiation (检测随机交配群体单倍型的非随机分布);

  14.Assignment test of genotype (通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中);

软件介绍

  Arlequin是一款专业的人类遗传学数据分析软件,这款软件主要为从事医学、生物学研究的用户设计,可以从遗传学和人口统计学数据中中挖掘信息,例如:大量的分子序列数据和传统的等基因频率,并提供了很多的方法和统计学检验,能够满足用户多种遗传学分析方便的需求!集成了单倍型频率估计、Tajima中性检验、Fu中性检验以及遗传距离的估计等功能。这样就能够准确有效的对人类遗传学数据进行挖掘。还在等什么,对遗传学有兴趣的用户可以通过软件对统计数据中信息的挖掘,可进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等。

更新日志:

Arlequin v3.5.2.2

  1、新功能:

  直接从DNA序列数据计算位点频谱,但仅基于次要等位基因频谱的SFS计算

  2、错误更正:

  无法打开批处理(.arb)文件

  当(假设祖先等位基因0)在一个站点不存在时,SFS计算不良

  由arlequin和fastsimcoal2生产的不同SFS(主要用于基于MAF的SFS)

  如果文件名超过255个字符,则会出错

  在arlequin日志文件中没有提到SFS计算

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