snapgene破解版怎么安装?snapgene安装使用详细图文教程

互联网   发布时间:2017-09-18 01:09:49   作者:佚名   我要评论

snapgene是什么软件?snapgene破解版怎么安装?下文小编就为大家整理了snapgene安装使用详细图文教程,需要的朋友抓紧看看

 snapgene中文版是一款非常优秀且界面简洁的DNA序列分析软件。可以帮助用户方便的分析酶切位点、标签、启动子、终止子和复制子等质粒原件,生成详细的DNA序列文件。小编还提供了snapgene使用教程,需要的朋友快快来下载snapgene中文版最新版

 

软件名称:
snapgene(dna序列分析工具) V2.3.0 安装破解版 (附破解补丁+破解教程)
软件大小:
29MB
更新时间:
2017-09-18

破解安装步骤:

安装“snapgene_2.3.2_win.exe”后运行**补丁“SnapGene_2.3.2_Windows_Crack.exe”,在“username”处填入想要显示的注册名,点击“patch”并定位到程序文件夹即可。

安装教程

1、双击“snapgene_1.1.3_win.exe”开始安装

2、点击next设置开始菜单文件夹名称

3、设置软件安装目录,默认为“C:\Program Files (x86)\SnapGene”

4、点击install安装即可

使用教程

 一、 SnapGene中的几个View介绍

View1:Map

 1. 打开一个质粒图谱文件,在Topology option处选择circular。得如下界面:

显示质粒图谱的酶切位点。右侧箭头可显示不同厂家出售的酶。

显示质粒图谱的开放阅读框及转录方向。点击其显示的箭头可显示该ORF的片段大小、GC%值等一些信息。

显示片段名称。

  △给非编码序列命名:如多克隆位点。先找到质粒图谱中的多克隆位点的第一个酶切位点和最后一个酶切位点。点击左侧sequence ,找到两个酶切位点之间的序列。

View2:Sequence

 点击Sequence,得到如下界面:

显示编码的氨基酸序列,有缩写和全写两种。

View3:

Enzymes 

 点击Enzymes,得到如下界面:

View4:Features

 点击Features,得到如下界面:

   显示各个已命名片段的一些特点。

二、 对片段进行注释

1.给编码序列命名:

点击其中一个箭头,按Feature→Add Translated Feature,弹出以下窗口:

Feature:给该片段命名。

Type:选择该片段的类型,右侧箭头代表阅读方向。

Color:选择颜色。

2. 给非编码序列命名:如多克隆位点。先找到质粒图谱中的多克隆位点的第一个酶切位点和最后一个酶切位点。点击左侧sequence,找到两个酶切位点之间的序列。

3. 给质粒图谱增加引物序列:按Edit→Find,输入引物序列,找到质粒序列对应位置,点击Primers→Addprimer,弹出该界面:

按上下游引物选择TopStrand还是BottomStrand,在Primer处可给该引物命名,随后即可显示该引物在图谱Map中的位置。

三、 创建新DNA文件 

1. 打开SnapGene,点击New DNA File,弹出以下窗口:

 

在Create the following sequence窗口下输入DNA序列,并对该文件命名,点击OK。或是点击Import from Genebank,输入NCBI中某序列的access number,点击OK。

2.此时弹出如下窗口:

3.对该序列进行注释:点击Features→Add Feature,对该序列进行命名注释。

△创建质粒图谱文件方法相同。

四、处理序列翻译信息

1.创建一个DNA序列文件,点击

2.显示如下箭头:

 黄色箭头代表的是上面一条链编码序列,绿色箭头代表的是下面一条链编码序列。

3.点击Sequence,点击右侧箭头,选择All 6 Frames,可得到编码序列的所有情况,其中代表的是终止密码子。

4.添加内含子:根据内含子的位置,点击Edit→Select Range,输入内含子碱基位置。点击Features→Delete Feature Segment,得到如下图:

紫色粗带为外显子,虚线为内含子部分。

五、引物、PCR和突变绘制

1.PCR引物绘制:在多克隆位点处找到合适的两个酶切位点。如BamHI和XbaI,在目的基因两侧截取15-30bp序列,点击Primers→Addprimers,选择top strand或bottom strand,如图:

给该引物命名,然后点击Insertion,在该引物上添加之前选择好的酶切位点序列,如图选择了BamHI,点解Insert:

 然后在该序列5端上添加数个碱基作为保护碱基。点击完成。

△下游引物设计相同,不再赘述。

2.突变引物绘制:在目的基因上截取一小段包含要突变位点的序列,点击Primers→Add primers,为该引物命名,在5’序列突变位点的三个碱基画黑,如图:

点击Insertions,选择突变成的氨基酸,点击Insert。即可获得该突变引物,点击Reverse Complement,可获得反向引物。

六、模拟标准限制性克隆

1.打开被插入片段的质粒图谱,选择合适的两个酶切位点,如HindIII和ApaI,如图:

点击Actions→Insert Fragment,点击HindIII+键盘Shift键+Apa,点击Insert,在source of fragment处选择插入的目的片段来源。点击上述同样的酶,给该重组质粒命名,点击clone。

七、 模拟融合克隆

1. 打开一个需要插入片段质粒图谱,点击Actions→Insert One Fragments,弹出以下窗口:

2. 点击sequence,找到想要发生替换的位点。 

3. 点击Fragment,在Source of Fragment处选择替换片段的另外一个质粒图谱。此时弹出另外一个质粒图谱图样。

4. 点击用于替换的片段,观察该片段阅读方向与被替换质粒位点的方向是否一致,如不一致,点击更换方向。 

5. 选择后,点击Product,点击Choose Overlapping PCR Primers,此时即形成融合后的质粒图谱。

6.若想获得引物的序列,点击Primers→Export Selected Primers,选择保存。

菜单中英文对照

菜单项:

1.file文件

new dna file:打开一个新的dna文件(可以选择是链状的还是环状的)

new file from selection 选取一段序列做为一个新文件

import from genbank :输入genbank号 即可属于序列

blast :基因序列和蛋白序列进行blast对比

2.edit编辑

copy top strand 复制顶链

copy bottom strand 复制低链

paste reverse complement 复制反向互补链

select all 全选

select range 选中你要求的序列

make uppercase 大写

make lowercase 小写

insert bases 插入基因

edit dna ends 编辑dna末端

change methylation 改变甲基化(酶切位点可能有影响)

find 查找基因序列

go to 达到对应号码的基因

3.view查看

map 显示图谱

sequence 显示序列

enzymes 显示酶切位点

features 显示特征序列

show top toolbars 显示顶部工具

show side toolbars 显示侧端工具

customize top toolbar自定义顶部工具栏

description panel 说明面板

zoom controls 焦距控制

font size 字体大小

map/sequence options 图谱和序列设定

translation options 翻译设定

flip sequence 翻转序列

set origin 设定原点

align with a sequence trace 跟另一个序列对比

4.enzymes:都是关于酶切位点的,很简单,第一次用的时候选择常用酶切位点,保存设置。

5.features

6.primers

7.actions

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