pytorch锁死在dataloader(训练时卡死)

 更新时间:2021年05月28日 09:34:02   作者:Totoro-wen  
这篇文章主要介绍了pytorch锁死在dataloader(训练时卡死),具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教

1.问题描述

2.解决方案

(1)Dataloader里面不用cv2.imread进行读取图片,用cv2.imread还会带来一系列的不方便,比如不能结合torchvision进行数据增强,所以最好用PIL 里面的Image.open来读图片。(并不适用本例)

(2)将DataLoader 里面的参变量num_workers设置为0,但会导致数据的读取很慢,拖慢整个模型的训练。(并不适用本例)

(3)如果用了cv2.imread,不想改代码的,那就加两条语句,来关闭Opencv的多线程:cv2.setNumThreads(0)和cv2.ocl.setUseOpenCL(False)。加了这两条语句之后,并不影响模型的训练。(并不适用本例)

(4)这种情况应该是属于pytorch多线程锁死,在github上看到有该问题,但是没有解决的。

参考建议

首先确保num_works数量低于CPU数量(如果使用Kubernetes,则设置为pod),但是设置得足够高,使数据随时可以用于下一次迭代。

如果GPU在t秒内运行每个迭代,而每个dataloader worker加载/处理单个批处理需要N*t秒,那么您应该将num_workers设置为至少N,以避免GPU停滞。当然,系统中至少要有N个cpu。

不幸的是,如果Dataloader使用任何使用K个线程的库,那么生成的进程数量就会变成num_workersK = NK。这可能比计算机中的cpu数量大得多。这会使pod节流,而Dataloader会变得非常慢。这可能导致Dataloader不返回批处理每t秒,导致GPU暂停。

避免K个线程的一种方法是通过OMP_NUM_THREADS=1 MKL_NUM_THREADS=1 python train.py调用主脚本。这就限制了每个Dataloader工作程序只能使用一个线程,从而避免了使机器不堪重负。你仍然需要有足够的num_workers来满足GPU的需要。

您还应该在_get_item__中优化您的代码,以便每个worker在较短的时间内完成其批处理。请确保worker完成批处理的时间不受从磁盘读取训练数据的时间(特别是当您从网络存储中读取数据时)或网络带宽(当您从网络磁盘读取数据时)的影响。如果您的数据集很小,并且您有足够的RAM,那么可以考虑将数据集移动到RAM(或/tmpfs)中,并从那里读取数据以进行快速访问。对于Kubernetes,您可以创建一个RAM磁盘(在Kubernetes中搜索emptyDir)。

如果你已经优化了你的_get_item__代码,并确保磁盘访问/网络访问不是罪魁祸首,但仍然会出现问题,你将需要请求更多的cpu(为了一个Kubernetes pod),或者将你的GPU移动到拥有更多cpu的机器上。

另一个选项是减少batch_size,这样每个worker要做的工作就会减少,并且可以更快地完成预处理。后一种选择在某些情况下是不可取的,因为会有空闲的GPU内存不被利用。

你也可以考虑离线做一些预处理,减轻每个worker的负担。例如,如果每个worker正在读取一个wav文件并计算音频文件的谱图,那么可以考虑离线预先计算谱图,只从工作者的磁盘中读取计算的谱图。这将减少每个worker的工作量。

你也可以考虑将dataloader里的设置pin_memory=False。

补充:pytorch加载训练数据集dataloader操作耗费时间太久,该如何解决?

笔者在使用pytorch加载训练数据进行模型训练的时候,发现数据加载需要耗费太多时间,该如何缩短数据加载的时间消耗呢?经过查询相关文档,

总结实际操作过程如下:

1、尽量将jpg等格式的文件保存为bmp文件,可以降低解码时间;

2、dataloader函数中增加num_workers参数,该参数表示加载数据的线程数,建议设置为该系统中的CPU核心数,若CPU很强劲,而且内存很大,也可以考虑将该数值设置的更大一些。

train_loader=torch.utils.data.DataLoader(dataset=train_dataset,batch_size=batch_size,shuffle=True)

修改为:

train_loader=torch.utils.data.DataLoader(dataset=train_dataset,batch_size=batch_size,shuffle=True,num_workers=multiprocessing.cpu_count())

虽然使用dataloader达到了iter(Dataset)的读取并行,但是没有实现在GPU运算时异步读取数据,可以考虑使用non_blocking实现。

dataloader = data.Dataloader(dataset, batch_size = batch_size, num_workers = workers)
for epoch in range(epochs):
    for batch_idx, (images, labels) in enumerate(dataloader):
        images = images.to(device)
        labels = labels.to(device)

改为:

dataloader = data.Dataloader(dataset, batch_size = batch_size, num_workers = workers, pin_memory = True)
for epoch in range(epochs):
    for batch_idx, (images, labels) in enumerate(dataloader):
        images = images.to(device, non_blocking=True)
        labels = labels.to(device, non_blocking=True)

需要注意的是:只有pin_memory=True并且num_workers>0时non_blocking才会有效。

以上为个人经验,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持脚本之家。

相关文章

  • python自动发送邮件脚本

    python自动发送邮件脚本

    这篇文章主要为大家详细介绍了python自动发送邮件的脚本源码,具有一定的参考价值,感兴趣的小伙伴们可以参考一下
    2018-06-06
  • tensorflow2.0的函数签名与图结构(推荐)

    tensorflow2.0的函数签名与图结构(推荐)

    这篇文章主要介绍了tensorflow2.0的函数签名与图结构,本文给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下
    2020-04-04
  • Python实现定位包含特定文本信息的元素

    Python实现定位包含特定文本信息的元素

    在Python编程中,特别是在进行网页数据抓取或自动化测试时,定位包含特定文本信息的元素是一项常见且重要的任务,下面我们来看看如何使用Python实现定位包含特定文本信息的元素吧
    2025-01-01
  • Python轻松实现批量邮件自动化详解

    Python轻松实现批量邮件自动化详解

    在日常工作和生活中,我们经常需要发送邮件,手动发送邮件不仅繁琐,而且容易出错,下面我们就来看看如何使用Python实现批量邮件自动化操作吧
    2025-02-02
  • Python多叉树的构造及取出节点数据(treelib)的方法

    Python多叉树的构造及取出节点数据(treelib)的方法

    今天小编就为大家分享一篇Python多叉树的构造及取出节点数据(treelib)的方法,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
    2019-08-08
  • Python实现常用文本内容提取

    Python实现常用文本内容提取

    在日常工作和学习中,我们经常需要从PDF、Word文档中提取文本,本文将介绍如何使用Python编写一个文本内容提取工具,有需要的小伙伴可以参考下
    2025-03-03
  • Python中 map()函数的用法详解

    Python中 map()函数的用法详解

    map( )函数在算法题目里面经常出现,map( )会根据提供的函数对指定序列做映射,在写返回值等需要转换的时候比较常用。这篇文章主要介绍了Python中 map()的用法,需要的朋友可以参考下
    2018-07-07
  • python数据库批量插入数据的实现(executemany的使用)

    python数据库批量插入数据的实现(executemany的使用)

    这篇文章主要介绍了python数据库批量插入数据的实现(executemany的使用),文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧
    2021-04-04
  • Python MD5加密实例详解

    Python MD5加密实例详解

    这篇文章主要介绍了Python MD5加密实例详解的相关资料,这里提供实现方法及实例,需要的朋友可以参考下
    2017-08-08
  • python 返回列表中某个值的索引方法

    python 返回列表中某个值的索引方法

    今天小编就为大家分享一篇python 返回列表中某个值的索引方法,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
    2018-11-11

最新评论