详情介绍
Cytoscape Mac版是Mac平台上的一款免费的开源应用。Cytoscape Mac版旨在帮助您可视化分子相互作用网络和生物路径,以及将网络与基因表达谱、注释和相关凝视数据集成在一起。
软件特色
Cytoscape Mac版最初是为生物学研究而创建的,后来扩展了其应用范围,成为复杂网络分析和可视化的通用平台。Cytoscape核心分布具有一组基本特性,专门用于数据分析、集成和可视化。您还可以使用以前称为插件的应用程序扩展该特性集,这些插件可用于网络和分子分析、新布局、扩展文件格式支持、脚本编写和与数据库的连接。
Cytoscape支持许多标准网络和注释文件格式,包括:SIF(简单交互格式),GML, XGMML,BioPAX, PSI-MI, GraphML, KGML(KEGG XML), SBML,OBO和基因关联。还支持定界文本文件和MS Excel™Workbook,并且您可以导入数据文件
二维布局网络。可以使用多种布局算法,包括循环,树形,力导向,边缘权重和yFiles有机布局。您还可以使用类似于其他图形应用程序用户界面的“手动布局”工具。
您可以将网络导出为可发布质量的图像。支持PDF,PS,SVG,PNG,JPEG和BMP文件。可以通过其他应用程序(例如Adobe Illustrator)修改矢量图像(PDF和PS),以进行进一步的增强
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